L’Université Grenoble Alpes est co-organisatrice des Rencontres Montagnes & Sciences depuis 2016 à Grenoble.
Le Centre National de la Recherche Scientifique, sa délégation CNRS Alpes et sa délégation CNRS Rhône Auvergne, participent également depuis 2014 à la co-organisation des Rencontres Montagnes & Sciences.
Le Campus UGA Valence Drôme Ardèche participe à l’organisation et à la communication pour les projections à Valence.
L’École normale supérieure de Lyon est une grande école scientifique et littéraire française. Elle participe à l'organisation et à la communication des Rencontres à Lyon.
L'université Clermont Auvergne participe à l'organisation du festival à Clermont-Ferrand, en Auvergne.
Le Centre interdisciplinaire de recherche sur la montagne de l'Université de Lausanne (UNIL) participe à l'organisation et à la communication des Rencontres au Châble.
Depuis la première édition en 2014, la Ville de Grenoble et sa Maison de la Montagne participe à l'événement en l'intégrant aux Rencontres Ciné Montagne.
La commune du Bourg-d'Oisans participe à l'organisation et à la communication des Rencontres sur son territoire.
La commune de L'Argentière-la-Bessée participe à l'organisation et à la communication des Rencontres sur son territoire.
La commune de Modane participe à l'organisation des Rencontres sur son territoire.
La communauté de communes Haute Maurienne Vanoise participe à l'organisation des Rencontres à Modane.
La communauté de communes de l'Oisans participe à l'organisation dl'organisation des Rencontres Montagnes & Sciences au Bourg d'Oisans.
Le Cinéma Le Navire participe à l'organisation des Rencontres à Valence.
Astu’Sciences participe à l’organisation, à la communication et à la coordination des bénévoles pour les projections à Clermont-Ferrand.
Le Groupement de Recherche d'Actions Culturelles a pour objectif la programmation et diffusion de spectacles en Maurienne. Il co-organise les Rencontres à Modane.
Alpes Magazine co-organise les Rencontres à Chambéry.
Le parc national des Écrins participe à l'organisation des Rencontres au Bourg d'Oisans et à L'Argentière-la-Bessée.
Le parc national de la Vanoise participe à l'organisation des Rencontres à Modane.
Le Centre régional d'études des populations alpines (CREPA) est un cparticipe à l'organisation des Rencontres au Châble.
Le Musée de Bagnes est basé au Châble, chef-lieu de la commune de Bagnes. Il participe à l'organisation des Rencontres dans cette ville valaisanne.
L'Institut national de recherches archéologiques préventives participe à l'organisation des Rencontres à Clermont-Ferrand.
Le groupe Spéléologie Auvergnat participe à l'organisation des Rencontres à Clermont-Ferrand.
Le laboratoire Magmas et Volcans participe à l'organisation des Rencontres à Clermont-Ferrand.
La réserve Chastreix Sancy participe à l'organisation des Rencontres à Clermont-Ferrand.
OSCITO participe à l'organisation des Rencontres à Clermont-Ferrand.
La mairie et la station de Tignes participent à l'organisation des Rencontres sur leur territoire.
Le Parc naturel régional des Volcans d'Auvergne participe à l'organisation des Rencontres à Clermont-Ferrand.